長春中醫藥大學前身是建于1950年的長春中醫進修學校，1958年長春中醫學院正式成立，2004年被列為吉林省重點高校，2006年經教育部批準正式更名為長春中醫藥大學。學校設有三個校區（凈月校區、紅旗校區、民主校區），總占地面積56.61萬方米(850畝)，總建筑面積26萬方米，凈月主校區坐落在風景宜人的凈月旅游經濟開發區。

學校具有較完整的教學、科研、醫療體系，設有11個教學單位，2所直屬三級甲等附屬醫院，5所非隸屬關系附屬醫院，其中3所為三級甲等醫院。有10所專科專病醫院，11個研究所，69個教學實基地。 學校現有教職工941人，具有高級專業技術職稱者417人，其中正高級專業技術人員122人，副高級專業技術人員295人。6位終身教授均為國內中醫藥界著名的專家學者。博士生導師13人，碩士生導師85人，享受國務院政府特殊津貼33人，省高級專家5人，國家及吉林省有突出貢獻的中青年專家15人。吉林省新世紀首席教授、主講教授各1人。 學校本科以上在校學生6400人，其中本科生5646人，研究生590人，留學生164人。
學校具有學士、碩士、博士學位授予權，形成了以中醫藥學科為主干，醫、理、工、管、文等相關學科門類協調發展的學科(專業)結構。設有13個本科專業，擁有博士學位授予權學科3個(其中1個為一級學科)，碩士學位授予權學科22個。 學校現有6個省部級重點學科。2004年，在國家高等學校與科研院所學位與研究生教育評估所組織的全國具有博士授權的一級學科整體水評估中，學校中醫學和中藥學分別排名第6位和第9位。5年來，獲省優秀教學成果獎51項，有省級優秀課程25門，省級精品課程5門，出版學術著作419部，主編、參編教材188部，發表論文2750篇。 學校現有1個國家科技部規范化中藥藥理實驗室，5個國家中醫藥管理局重點實驗室。5年，學校承擔國家級科研項目28項、省部級科研項目255項。獲縱、橫向科研經費11015.4